基因工程酶及其融合蛋白
除了基因工程抗原、抗体外，与标记免疫测定有关的另一中重要的基因工程试剂就是酶及其融合蛋白，以重组酶建立免疫测定方法较为成功的是CEDIATM均相酶免疫试验。
使用基因工程酶技术免疫测定标记酶，是得到符合标记要求的高纯度酶的一条新途径，但如以其他蛋白（抗原或抗体）融合的方法，不但避免了繁琐且低效率的酶与蛋白的化学交联，而且无需得到纯化的酶和抗原或抗体。随着分子生物学技术的发展，将有越来越多的酶免疫测定方法建立在基因工程酶或其融合蛋白的基础之上。
发展趋势如下：
1）、由单一病原蛋白向多决定簇融合蛋白转变，并尽可能包括病原体基因组功能区的所有的能引起肌体免疫应答的决定簇。
2）、表达的抗原将尽可能少含有非特异性抗原 或共同抗原。
3）、为某一目的如病原体基因型确定而设计表达特定的多肽抗原片断。
总之，将围绕改善免疫测定的特异性和敏感性来制备基因工程片断。